Policlinico di Modena

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numero verde regionale 118

Reparti e Servizi

Laboratori, Anatomia Patologica e Medicina Legale


Microbiologia e Virologia


Responsabile: dottor Fabio Rumpianesi

Sede: ingresso n. 31, piano 1°

  • Segreteria
    • Telefono: Tel. 059.422.3763 Fax: 059.422.3625
    • E-mail: microviro.seg@policlinico.mo.it
    • Orari: Dal Lunedi al Venerdi dalle ore 8 alle ore 16; sabato dalle ore 8 alle ore 13.

Presentazione

La Struttura Complessa di Microbiologia e Virologia del Policlinico di Modena svolge una attività legata alla diagnosi eziologica delle patologie da infezione di origine batterica, virale, micotica e parassitaria.

Il Laboratorio si è costantemente adeguato alle innovazioni tecnologiche ed alle “nuove” esigenze diagnostiche che si sono susseguite negli ultimi anni e gli operatori hanno sviluppato una expertise che consente di sostenere positivamente il confronto con i migliori Centri Nazionali ed Europei come documentato dal posizionamento sempre al di sopra della media nei Controlli di Qualità Esterni Internazionali e dai numerosi lavori pubblicati sulle più importanti riviste scientifiche .

Il Laboratorio di Microbiologia e Virologia del Policlinico è:

  • Laboratorio di Riferimento Regionale per la diagnosi delle infezioni da Legionella pneumophila (Delibera della Giunta Regionale 21 Luglio 2008 n° 1115).
  • Centro di Riferimento Provinciale per la diagnosi eziologica delle Malattie da Infezione,
  • Centro di Riferimento Regionale per la diagnosi della Farmacoresistenza dei ceppi virali di HIV-1 e per la Genotipizzazione dei batteri responsabili delle Infezioni nelle Strutture Sanitarie.

Inoltre:

  • fa parte della “Commissione consultiva tecnico-scientifica per gli interventi di prevenzione e lotta all’AIDS” istituita dalla Regione Emilia Romagna (Delibera di Giunta n° 1778 del 22/11/2010)
  • è stato selezionato dall’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS), come membro stabile di un network internazionale costituito da 33 laboratori, per la determinazione e valutazione di stabilità degli Standard Internazionali di HCV RNA Viral Load
  • partecipa al Gruppo di Lavoro Nazionale dell’Associazione Microbiologi Clinici Italiani (AMCLI) per il monitoraggio delle infezioni virali nei trapianti di organo solido e di midollo.
  • fa parte del Board Regionale, coordinato dalla Agenzia Sanitaria e Sociale della Regione Emilia-Romagna, per lo studio e sorveglianza dell’antibioticoresistenza.
     

Le principali Sezioni del Laboratorio sono: Microbiologia, Sieroimmunologia, Virologia , Biologia Molecolare

Attività

Settore di Microbiologia: Batteriologia, Micobatteriologia, Micologia, Parassitologia
 
  • Esami microscopici, colturali ed esami di valutazione della farmacoresistenza ai farmaci antimicrobici secondo le più recenti metodiche validate a livello internazionale
  • Diagnosi di laboratorio delle infezioni da miceti: dermatofiti, miceti filamentosi e lieviti patogeni con esecuzione dell’antimicoticogramma e dosaggio del galattomannano nel siero dei pazienti e nel BAL
  • Consulenza sulle tematiche di microbiologia clinica relative alla scelta degli esami da eseguire ed all’interpretazione dei risultati: stesura di protocolli, linee guida e procedure.
  • Partecipazione al Progetto aziendale e regionale “Sopravvivere alla sepsi”
  • Partecipazione al progetto TB-CCM coordinato dall’Istituto Superiore di Sanità per il controllo di qualità della diagnosi di laboratorio nelle infezioni da Mycobacterium tuberculosis
  • Ricerca colturale e tipizzazione di Legionella pneumophila
  • Partecipazione al Board Regionale che coordina lo studio e la sorveglianza dell’antibioticoresistenza
  • Partecipazione alle iniziative formative AMCLI sulla gestione degli antibiogrammi secondo i criteri EUCAST
  • Partecipazione alle iniziative del Comitato Infezioni Ospedaliere (CIO) per la prevenzione ed il controllo delle infezioni associate all’assistenza:
  • Realizzazione dell’ Osservatorio Microbiologico con reportistica specifica per valutare la circolazione dei microrganismi patogeni ed i trend di farmocoresistenza
  • Segnalazione informatica dell’isolamento di microrganismi ad alta pericolosità (Eventi Sentinella) e di eventuali picchi epidemici ai Reparti e al Gruppo Operativo del Servizio di Prevenzione e Protezione area Igiene Ospedaliera.
  • Ricerca dei portatori o colonizzati di microrganismi di rilevanza epidemiologica
  • Mantenimento di una “ceppoteca” per studiare eventi epidemici e per tipizzare i ceppi batterici
Settore di Sieroimmunologia
  • Metodiche di secondo livello per la ricerca:
    • di anticorpi IgA anti- Toxoplasma gondii con metodica Western Blot
    • dell’ “Avidità” degli anticorpi IgG anti-Toxoplasma gondii
    • i anticorpi anti Borrelia burgdorferi con metodica Western Blot
    • di anticorpi anti Treponema pallidum con metodica Western Blot
    • di anticorpi anti Rosolia e Citomegalovirus con metodica “Avidity IgG” e “Western-blot”
  • Metodiche di conferma per la diagnosi di infezione da HIV 1/2
  • Ricerca degli anticorpi anti-virus respiratori
  • Ricerca del pannello anticorpale nei confronti del Virus di Epstein-Barr (EBV)
  • Ricerca degli anticorpi e degli antigeni di Legionella pneumophila
  • Studio della risposta immune di tipo cellulo-mediata verso Mycobacterium tuberculosis mediante metodica QuantiFERON TB.
Settore di Virologia: Isolamenti colturali virali e Ricerca antigeni
  • Isolamento virale mediante l’impiego di colture cellulari in vitro (requisito dei laboratori virologici di riferimento)
  • Monitoraggio della riattivazione di CMV, nei trapianti di organo solido o midollo ed in generale di tutte le situazioni di immunodeficienza mediante la tecnica dell’Antigenemia
  • Utilizzo di metodiche di “Diagnosi Virale Rapida” in particolare per i virus respiratori e per i virus causa di gastroenterite.
Settore di Biologia Molecolare:
  • Identificazione di Chlamydia trachomatis e Mycobacterium tuberculosis mediante Transcription Mediated Amplification (TMA)
  • Identificazione di Mycobacterium tuberculosis multiresistenti mediante reverse ibridization (LiPA- Line Probe Assay)
  • Identificazione di micobatteri non tubercolari mediante reverse ibridization (LiPA- Line Probe Assay) e sequenziamento genico
  • Identificazione di batteri e miceti mediante sequenziamento genico
  • Tipizzazione molecolare di batteri responsabili di infezioni nosocomiali mediante RAPD, ERIC-PCR, AP-PCR, PCR-RFLP, REP-PCR e sistema DiversiLab.
  • Tipizzazione molecolare di Legionella pneumophila mediante Sequence Based Typing (SBT) (EWGLI)
  • Identificazione di Aspergillus spp. mediante Real Time PCR.
  • Identificazione di Pneumocystis jiroveci mediante PCR
  • Diagnosi e monitoraggio delle infezioni da HIV1, HCV e HBV mediante PCR, nested PCR , Real Time PCR, TMA
  • Valutazione della farmacoresistenza di HIV e tropismo virale attraverso sequenziamento genico (regioni pol, env e integrasi)
  • Genotipizzazione HCV mediante LiPA
  • Diagnosi di infezione virale del Sistema Nervoso Centrale mediante nested PCR, Real Time PCR
  • Diagnosi di infezione e riattivazione virale in pazienti trapiantati di midollo e di organo solido mediante nested PCR, Real Time PCR
  • Identificazione e tipizzazione molecolare di Papillomavirus (HPV ) ad alto e basso rischio oncogeno mediante PCR, nested PCR e LiPA

Tutte le Sezioni partecipano a Controlli di Qualità Esterni internazionali (NEQAS, QCMD) e nazionali (Istituto Superiore di Sanità) e partecipano a vari progetti di ricerca.

DATI DI ATTIVITA’

Nel 2010 il Laboratorio di Microbiologia e Virologia ha eseguito 270.000 prestazioni diagnostiche per una valorizzazione di euro 4.500.000 Negli ultimi tre anni è notevolmente aumentata (+ 8%) la valorizzazione complessiva delle prestazioni diagnostiche erogate ed è aumentato anche il valore medio della singola prestazione         (+ 10%) a conferma della sempre maggiore complessità della attività svolta

RICERCA

L’attività di ricerca che affianca e supporta l’attività assistenziale, consente di trasferire nella pratica routinaria i risultati sperimentali ottenuti e di svolgere un’ attività di livello altamente qualificato con l’impiego delle metodologie più avanzate. Ne sono testimonianza le numerose pubblicazioni su riviste internazionali e la partecipazione ai più prestigiosi Congressi.

Di particolare prestigio la prima segnalazione a livello mondiale di infezione neuroinvasiva da Usutu virus e la descrizione di una nuova specie di micobatterio denominata Mycobacterium europaeum

I principali settori di ricerca sono:

  • Studio delle infezioni nei pazienti trapiantati
  • Studio dei meccanismi di antibiotico resistenza
  • Studio della farmacoresitenza nei pazienti con infezione da HIV
  • Tipizzazione molecolare dei micobatteri
  • Studio delle infezioni da miceti
  • Messa a punto di nuovi sistemi diagnostici

Negli ultimi cinque anni sono state prodotte dagli operatori del Laboratorio 44 pubblicazioni su riviste internazionali recensite su PubMed con un Impact Factor complessivo di 192,863.

DIDATTICA E FORMAZIONE

Sul Laboratorio di Microbiologia e Virologia insistono insegnamenti ed attività di tirocinio nell’ambito del Corso di Laurea di Medicina e Chirurgia; del Corso di Laurea in Tecniche di Laboratorio Biomedico e del Corso della Scuola di Specialità in Microbiologia e Virologia dell’Università di Modena e Reggio Emilia L’attività didattica e di tutoraggio impegna a vario titolo tutto il personale che organizza inoltre eventi formativi accreditati sia “sul campo” che aperti ad utenti esterni.

 

 

 

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Equipe laureati


dottor Fabio Rumpianesi
direttore
  • Dr.ssa A. Fabio
    Dr. W. Gennari
    Dr.ssa A. La Regina
    Dr.ssa M. Meacci
    Dr.ssa M. Pecorari
    Dr.ssa P. Pietrosemoli
    Dr.ssa A.M.T. Sabbatini
    Dr.ssa C. Venturelli
    Dr.ssa G. Fabio, Ricercatore non convenzionato
    Dr.ssa A. Grottola, Tecnico laureato universitario non convenzionato
Coordinatore Tecnico: Anna Rita Mattioli